Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm17093F6XGJ4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm17093F6XGJ4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm17093F6XGJ4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms