Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atf6F6VAN0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atf6F6VAN0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atf6F6VAN0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atf6F6VAN0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms