Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Raph1F2Z3U3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Raph1F2Z3U3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Raph1F2Z3U3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms