Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh18E9Q9Q6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh18E9Q9Q6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.5 ms