Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc146E9Q9F7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc146E9Q9F7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc146E9Q9F7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms