Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
6030445D17RikE9Q8F9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
6030445D17RikE9Q8F9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
6030445D17RikE9Q8F9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
6030445D17RikE9Q8F9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
6030445D17RikE9Q8F9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
6030445D17RikE9Q8F9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
6030445D17RikE9Q8F9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms