Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Simc1E9Q6E9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Simc1E9Q6E9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Simc1E9Q6E9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms