Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20518E9Q548 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms