Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aldh3b2E9Q3E1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Aldh3b2E9Q3E1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Aldh3b2E9Q3E1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Aldh3b2E9Q3E1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms