Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Speer4f2E9Q366 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Speer4f2E9Q366 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Speer4f2E9Q366 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f2E9Q366 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Speer4f2E9Q366 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f2E9Q366 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f2E9Q366 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Speer4f2E9Q366 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f2E9Q366 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Speer4f2E9Q366 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms