Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt90E9Q1Z0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt90E9Q1Z0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms