Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r68E9Q0V3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r68E9Q0V3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r68E9Q0V3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r68E9Q0V3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r68E9Q0V3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r68E9Q0V3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r68E9Q0V3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r68E9Q0V3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms