Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim5E9PV98 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim5E9PV98 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 365.8 ms