Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
1110002E22RikE0CYV9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1110002E22RikE0CYV9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1110002E22RikE0CYV9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1110002E22RikE0CYV9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms