Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms