Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
3425401B19RikD3Z1D3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
3425401B19RikD3Z1D3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
3425401B19RikD3Z1D3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
3425401B19RikD3Z1D3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
3425401B19RikD3Z1D3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms