Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700015F17RikD3YUK8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700015F17RikD3YUK8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms