Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptprz1B9EKR1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptprz1B9EKR1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ptprz1B9EKR1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms