Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf11bB4XVQ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf11bB4XVQ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf11bB4XVQ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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