Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clrn2B2RVW2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clrn2B2RVW2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clrn2B2RVW2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clrn2B2RVW2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms