Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrt4B2RU40 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrt4B2RU40 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prrt4B2RU40 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prrt4B2RU40 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms