Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Ythdc2B2RR83 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ythdc2B2RR83 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ythdc2B2RR83 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ythdc2B2RR83 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms