Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brpf3B2KF05 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brpf3B2KF05 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brpf3B2KF05 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms