Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prr29B1ARI9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Prr29B1ARI9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prr29B1ARI9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prr29B1ARI9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prr29B1ARI9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms