Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprsB0V2N1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtprsB0V2N1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PtprsB0V2N1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprsB0V2N1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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PtprsB0V2N1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprsB0V2N1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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