Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Skint2A7XUX6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Skint2A7XUX6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms