Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F6

Ttll13, Tubulin polyglutamylase TTLL13, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll13A4Q9F6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ttll13A4Q9F6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ttll13A4Q9F6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ttll13A4Q9F6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ttll13A4Q9F6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ttll13A4Q9F6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms