Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Svep1A2AVA0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms