Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Svep1A2AVA0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Svep1A2AVA0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Svep1A2AVA0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Svep1A2AVA0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms