Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pramef17A2ASJ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pramef17A2ASJ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pramef17A2ASJ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pramef17A2ASJ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms