Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Patl2A2ARM1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Patl2A2ARM1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Patl2A2ARM1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Patl2A2ARM1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms