Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam205aA2APU8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam205aA2APU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam205aA2APU8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam205aA2APU8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam205aA2APU8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam205aA2APU8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam205aA2APU8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam205aA2APU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam205aA2APU8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam205aA2APU8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam205aA2APU8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam205aA2APU8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms