Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc183A2AJB1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc183A2AJB1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc183A2AJB1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms