Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930447F04RikA2AFR2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930447F04RikA2AFR2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.7 ms