Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf19bA2A7Q9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
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Rnf19bA2A7Q9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Rnf19bA2A7Q9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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Rnf19bA2A7Q9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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Rnf19bA2A7Q9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf19bA2A7Q9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf19bA2A7Q9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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