Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpc1lA2A5N3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpc1lA2A5N3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pabpc1lA2A5N3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms