Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms