Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVR5

Rasgef1a, RasGEF domain family, member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rasgef1aA0A0N4SVR5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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