Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3aP28741 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3aP28741 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms