Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrit3W8DXL4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrit3W8DXL4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrit3W8DXL4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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