Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mbd3Q9Z2D8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms