Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn7Q9Z261 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn7Q9Z261 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn7Q9Z261 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms