Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ5

Apip, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApipQ9WVQ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ApipQ9WVQ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ApipQ9WVQ5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ApipQ9WVQ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms