Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apobec2Q9WV35 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec2Q9WV35 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apobec2Q9WV35 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apobec2Q9WV35 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms