Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bgrQ9WUZ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms