Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema6cQ9WTM3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sema6cQ9WTM3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sema6cQ9WTM3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms