Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb3Q9R1P1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms