Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt71Q9R0H5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt71Q9R0H5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt71Q9R0H5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt71Q9R0H5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt71Q9R0H5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt71Q9R0H5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt71Q9R0H5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt71Q9R0H5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt71Q9R0H5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt71Q9R0H5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt71Q9R0H5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt71Q9R0H5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms