Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NrkQ9R0G8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NrkQ9R0G8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NrkQ9R0G8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NrkQ9R0G8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
NrkQ9R0G8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NrkQ9R0G8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NrkQ9R0G8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms