Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh2d3cQ9QZS8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh2d3cQ9QZS8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms