Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpc3Q9QZC1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpc3Q9QZC1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpc3Q9QZC1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc3Q9QZC1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms